ارزیابی فیلوژنتیکی تنوع ژنومی بر اساس ژن کلروپلاستی matk و نتایج نشانگر مولکولی rapd در اکوتیپ های عناب(.ziziphus spp) ایران
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه فردوسی مشهد - دانشکده کشاورزی
- نویسنده سمیه عباسی
- استاد راهنما سعید ملک زاده شفارودی کمال غوث
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1389
چکیده
چکیده عناب گیاه داروئی ارزشمندی است که در طب سنتی ایران جایگاه ویژه ای دارد. با تمام اهمیتی که گیاهان منطقه ای مانند عناب در اقتصاد و اشتغال زائی مناطق مختلف کشور دارند، در عرصه پژوهش و فناوری جزء گیاهان فراموش شده به حساب می آیند. با عنایت به اهمیت اقتصادی و داروئی عناب، اولین قدم برای برنامه های اصلاحی آن، اطلاع از تنوع ژنتیکی و روابط خویشاوندی بین ارقام مختلف آن است. لذا در این پژوهش از 34 اکوتیپ عناب که از هشت استان عناب خیز کشور جمع آوری شده اند، استفاده گردید. به منظور بارکد گذاری dna با استفاده از ژن matk و بررسی تنوع ژنتیکی با استفاده از نشانگر rapd در گیاه عناب، دو آزمایش مستقل انجام گردید. در آزمایش اول پس از استخراج dna، ژن matk در اغلب نمونه ها تکثیر و توالی یابی شد. توالی های بدست آمده بیشترین شباهت ژنتیکی را با گونهziziphus jujuba voucher نشان دادند. نتایج ارزیابی توالی ژن کاندیدای بارکدگذاری، حاکی از دسته بندی اکوتیپ های مورد بررسی در دو گروه ژنتیکی بود. گروه اول شامل اکوتیپ های قابل انتساب به گونه z. jujuba بودند در حالیکه اکوتیپ های گروه دوم حضور محتمل گونه ای دیگر را نشان دادند که کمبود اطلاعات درباره ژن matk در گونه های متعدد، مانع از نتیجه گیری قطعی در این رابطه شد. همچنین در آزمایش دوم، تنوع ژنتیکی اکوتیپ های عناب ایران توسط 15 آغازگر rapd مورد بررسی قرار گرفت که 6 آغازگر در بین نمونه ها دارای چندشکلی مطلوبی بودند. گروه بندی اکوتیپ ها به روش تجزیه خوشه ای و با استفاده از الگوریتم upgma انجام شد که نمونه ها به دو گروه اصلی در ضریب شباهت 82/0 تفکیک شدند. بیشترین شباهت ژنتیکی (92?) میان اکوتیپ های مازندران و گلستان و بیشترین تنوع در اکوتیپ های خراسان جنوبی مشاهده شد. نتایج این مطالعه حکایت از وجود تنوع ژنتیکی مناسب جهت بهره گیری در پروژه های به نژادی آتی داشت. واژه های کلیدی: عناب، ژن matk، بارکدگذاری، تنوع ژنتیکی، rapd
منابع مشابه
گروهبندی عنابهای ایران بر اساس صفات کمی و نشانگرهای ISSR و RAPD
عناب (Zizyphus jujuba Mill.) یکی از گیاهان باغی مهم با گونهها و واریتههای متنوع در منطقه آسیای مرکزی و غربی است که در بسیاری از مناطق و استانهای ایران پراکنش طبیعی دارد. این تحقیق با هدف بررسی تنوع ژنتیکی و ژنومی با استفاده از صفات کمی و مارکرهای مولکولی ISSR و RAPD در کلکسیون عناب ایران، شامل نمونههای جمعآوری شده از هشت استان، در استان خراسان جنوبی انجام شد. تنوع قابل ملاحظهای در میان 29...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی بین و درون جمعیت¬های شمشاد در جنگل¬های شمال ایران با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD
بهمنظور بررسی تنوع ژنتیکی بین و درونجمعیتی، سه جمعیت طبیعی شمشاد (Buxus hyrcana Pojark.) در شمال کشور (چشمهبلبل بندرگز، سیسنگان نوشهر و قرنآباد گرگان) با استفاده از نشانگرهای مولکولی RAPD بررسی شدند. نتایج نشان داد که تنوع ژنتیکی بهنسبت مطلوبی (حدود 29 درصد) در جمعیتهای مورد بررسی وجود دارد، بهگونهای که از 9/22 درصد در جمعیت قرنآباد گرگان تا 3/28 درصد در ...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی مهم ترین ارقام نیشکر در ایران با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD
این مطالعه به منظور بررسی تنوع ژنتیکی و میزان خویشاوندی 35 رقم نیشکر با استفاده از 65 آغازگر RAPD برای تعیین سطح تنوع ژنتیکی و خویشاوندی در برخی از واریتههای تجاری S. officinarum و همچنین دو رقم وحشی S. spontaneum در ایران استفاده شد. DNA ژنومی هر رقم از برگهای جوان تازه روئیده بر اساس روش تغییر یافته CTAB استخراج شد و در حجم مناسبی از بافر TEحل گردید و غلظت آن توسط دستگاه بیوفتومتر انداز...
متن کاملارزیابی برخی از ژنوتیپهای گردو در غرب ایران براساس ویژگیهای ریختشناسی میوه و نشانگر مولکولی RAPD
گردوی ایرانی (Juglans regia L.) متعلق به خانوادة گردوسانان (Juglandaceae) و یکی از مهمترین محصولات خشکبار در ایران است. در پژوهش حاضر، برخی ژنوتیپهای جمعآوریشدة گردو از مناطق مختلف غرب ایران براساس ویژگیهای میوه و نشانگر مولکولی RAPD ارزیابی شدند. بررسی حاضر در قالب دو آزمایش جداگانه انجام شد که در آزمایش اول، توانمندی ژنتیکی 119 ژنوتیپ گردو براساس 29 ویژگی مربوط به دانه و مغز ارزیابی شد. ...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی برخی از پایه های پاکوتاه کننده سیب با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD
در این تحقیق تنوع ژنتیکی 19 پایه اصلاح شده سیب در انگلستان و روسیه که از مناطق مختلف ایران جمع آوری شده همراه با 12 ژنوتیپ و پنج نمونه حاصل از کشت بافت به کمک نشانگرDNA (RAPD) مورد بررسی قرار گرفت. تعداد 100 آغازگر تصادفی در انجام واکنش PCR روی نمونه ها ارزیابی شد که 10 آغازگر تکثیر DNA الگو را به خوبی انجام داده و بین نمونه ها چند شکلی قابل ملاحظه ای نشان دادند. این 10 آغاز گر در مجموع 160 بان...
متن کاملچشم اندازی از ژن کلروپلاستی matk
ژن کلرپلاستیmatk ، که به عنوان orf509 شناخته شده ، دارای سرعت تکاملی بالا در سطوح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی است. این ژن در کپی منفرد بزرگ ژنوم کلروپلاست و بین اگزون های ‘5 و ‘3 trnk (trna-lysine) در درون یک اینترون گروه ii واقع شده است. اثر نور و مرحله نموی بر سطوح rna و پروتئین matk، پیشنهاد کننده نقش کارکردی این ماچوراز مشهور است که به طور غیر مستقیم بر فتوسنتز اثر می گذارد. matk یکی از مناسب ت...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه فردوسی مشهد - دانشکده کشاورزی
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023